帮助分析单细胞数据的新方法

CITE-seq（细胞对转录子和表位的标记）是一种基于RNA测序的方法，可以在单个细胞读数中同时定量所有表面蛋白和转录组学数据目前，研究人员在细胞类型、疾病状态或其他条件方面的能力高于以往

虽然CITE解决了检测有限蛋白质数量的问题，但在无偏通道中对单个细胞进行测序时，其中一个限制是可能阻碍分析的高水平背景噪声

为了解决这一问题，来自波士顿大学的研究人员Chobanian&；AvedisianSchool of Medicine and CollageofArtsandSciences开发了一种新的工具，可以识别和消除来自各种来源的不必要的背景噪音

“我们创建了DecotPro，这是一个专门的模型，可以净化在CITE seqdata中观察到的两种污染源，”负责人JoshuaCampbell博士解释道，他是该校医学教授的助理他说：“它可以作为一种重要的质量评估工具，有助于下游分析，并帮助研究人员了解疾病的发病机制。”

研究人员仔细检查了几个公开的可用数据集，这些数据集对CITE发布的不同类型的软件进行了分析，并发现了一种不同类型的事实，他们称之为“海绵”。这些海绵在某些数据集中造成了大量的背景噪声研究人员发现，Decont定位并移动不同的背景噪声源，包括海绵、悬浮液中可能存在的环境材料或非特定结合的扇形体的噪声

MasanaoYajima，博士，数学与统计系实践教授，“解构Proisa Bayesian层次结构模型。我们精心构建了它，以确保在没有政府干预的情况下，对来自噪声的细胞数据集的信号进行处理。”

这些定义在我们的核酸研究中是在线的

资金由来自汉祖克伯格倡议的专家提供