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端粒到端粒基因组组装研究为新作物品种打开了大门

本站发布时间:2024-08-28 12:27:29

得益于今天发表在《自然遗传学》上的国际基因组学研究,可以更好地抵御干旱、盐度和害虫的全新作物品种触手可及

这项名为“利用端粒到端粒基因组组装解锁植物遗传学”的研究由默多克大学作物与食品创新中心(CCFI)的研究人员领导

完整的端粒到端粒(T2T)组装使科学家能够绘制整个基因组,以支持分子育种,提高植物在胁迫条件下的表现

研究负责人兼CCFI主任Rajeev Varshney教授表示,基因组组装的发现代表了遗传学的未来

Varshney教授说:“基因组组装本质上就像一块一块地构建拼图。T2T基因组组装提供了一个完整的、端到端的基因组全貌。”

“我们的工作是确保基因组中的数千个基因沿着整个染色体以正确的顺序组装,并且每个片段都完美地结合在一起。”

第一作者兼CCFI研究员Vanika Garg博士说,基因测序现在可能达到的准确度导致了这一突破

Garg博士说:“到目前为止,T2T基因组组装还不可能,不完整的基因测序可能会导致错误,如注释错误。”

“这意味着负责某些理想性状的基因被遗漏了。但由于测序技术的进步,我们终于可以为任何作物物种进行T2T基因组组装。”

Varshney教授和他的研究团队目前正在与澳大利亚、英国、德国、美国和中国的几个实验室合作,为小麦、鹰嘴豆、蚕豆、木瓜、百香果、奶油冻苹果、香蕉和菠萝等几种作物开发T2T基因组组件或几乎完整的基因组组件

Varshney教授说:“我们正在与我们的国家和国际合作者一起,将T2T基因组组装方法应用于几种作物,并非常兴奋地看到这将如何推动澳大利亚和国外的农业研究。”

“T2T基因组组装允许访问难以测序的区域,这开辟了无数突破性的研究可能性,例如创造满足我们未来需求的全新作物品种。”

More information: Vanika Garg et al, Unlocking plant genetics with telomere-to-telomere genome assemblies, Nature Genetics (2024). DOI: 10.1038/s41588-024-01830-7

Journal information: Nature Genetics

Provided by Murdoch University

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