研究人员开发了快速测量蛋白质相互作用的工具，用于药物发现

由多伦多大学研究人员领导的一个团队创建了一个名为SIMPLE2的平台，该平台通过简化检测同时提高测量精度来改进蛋白质相互作用的研究

蛋白质之间的相互作用在生物过程中起着重要作用，包括那些与疾病有关的过程。SIMPLE2平台背后的团队设计它是为了优化研究人员测量靶向药物治疗中蛋白质相互作用的能力。虽然蛋白质-蛋白质相互作用以前被认为是使用小分子“不可治疗”的，但该平台通过促进对这些相互作用的测量来应对这一挑战，从而提高了我们对控制它们所需的分子类型的理解

“已经开发了许多方法来测量蛋白质之间的相互作用，特别是最近蛋白质相互作用在疾病中的意义变得更加明显，”该研究的第一作者、多伦多大学唐纳利细胞和生物分子研究中心的高级研究员钟耀说

“然而，所有这些方法都有缺点，包括高成本和延迟结果的复杂程序。我们的SIMPLE2平台的最大优点是它产生了更可靠的测量结果，并且使用起来相对便宜。”

该研究最近发表在《分子系统生物学》杂志上

姚在开发最初的SIMPL（Split Intein药物蛋白连接）系统时开始研究蛋白质相互作用测量问题。SIMPLE2是SIMPL的更新，涉及使用分裂萤光素酶通过发光检测蛋白质相互作用。除了改进相互作用的识别外，整个测量过程还通过一种介质进行：液体。这通过减少进行测量所需的步骤数量大大简化了过程

“这是一个痛苦的过程，使一项原本有效的技术比实际需要的更复杂、更昂贵。SIMPLE2只需要一个步骤，可以手动执行，也可以自动化，以便在高通量研究中更高效。”

为了测试新平台的敏感性和适用性，研究小组用它来测量受调节剂影响的蛋白质之间的相互作用。蛋白质调节剂包括抑制蛋白质相互作用的分子、促进蛋白质相互作用和促进靶蛋白降解的分子。发现SIMPLE2在识别这些相互作用方面表现良好，即使在相互作用较弱的情况下也是如此

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虽然量子计算机和人工智能使设计用于药物治疗的小分子变得更加容易，但这也导致了需要开发更快的方法来验证新药的疗效。SIMPLE2可以满足这一需求，因为它可以用于测试培养的人类细胞中新分子与其靶蛋白之间的相互作用。它还能够跟上新分子设计的速度

该研究的首席研究员、多伦多大学特默蒂医学院生物化学教授Igor Stagljar说：“我们设计SIMPLE2是一种快速、廉价且高度敏感的研究蛋白质相互作用的通用方法。”

“现在我们已经优化了该平台，我们的下一步是使用它来研究在疾病（如癌症）中发挥关键作用的相互作用，以学习如何开发药物疗法。这项工作将涉及量子计算机和人工智能的使用，并与T大学的Alán Aspuru-Guzik实验室和生成性人工智能药物发现的全球领导者Insilico Medicine合作。”