人工智能如何强力增强植物免疫力以对抗致命细菌

科学家利用人工智能强化植物免疫系统,有望彻底改变番茄、马铃薯等作物抵御有害细菌的方式。通过基因重组识别细菌威胁的植物受体,研究团队正在提升植物的抗病性,为培育更具韧性的未来作物奠定基础。

植物与动物一样拥有免疫系统。其防御工具箱的一部分包括免疫受体,这赋予它们检测细菌并抵御细菌的能力。其中一个名为FLS2的受体,能帮助植物识别鞭毛蛋白——这是一种存在于细菌用于游动的微小尾部中的蛋白质。但细菌十分狡猾,并且不断进化以避免被检测到。

"细菌与其植物宿主正在进行一场军备竞赛,它们能改变鞭毛蛋白中的基础氨基酸以逃避检测,"首席作者、植物病理学系教授吉塔·科克(Gitta Coaker)说。

为了帮助植物跟上步伐,科克的团队转向利用自然变异与人工智能相结合的技术——特别是AlphaFold(一种为预测蛋白质三维结构而开发的工具),并重新设计了FLS2受体,实质上是升级其免疫系统以捕获更多入侵者。

该团队专注于已知能识别更多细菌的受体,即使它们尚未在有用的作物物种中发现。通过将这些受体与识别范围较窄的受体进行比较,研究人员得以确定需要改变的氨基酸。

"我们能够复活一个被病原体击败的受体,使植物有机会以更具针对性和精确性的方式抵抗感染,"科克说。

研究意义

科克表示,这为利用预测设计开发作物的广谱抗病性打开了大门。

 

研究者的目标之一是一种主要的作物威胁:Ralstonia solanacearum(青枯菌),它是细菌性枯萎病的病因。这种土传病原体的某些菌株可感染超过200种植物,包括番茄和马铃薯等主要粮食作物。

展望未来,该团队正在开发机器学习工具,以预测未来哪些免疫受体值得编辑。他们也在努力减少需要改变的氨基酸数量。

这种方法可采用类似策略,用于增强其他免疫受体的感知能力。

研究的其他作者包括加州大学戴维斯分校的李天润(Tianrun Li)、埃斯特班·哈尔昆·博拉尼奥斯(Esteban Jarquin Bolaños)、丹妮尔·M·史蒂文斯(Danielle M. Stevens)和沙汉旭(Hanxu Sha),以及劳伦斯伯克利国家实验室的丹尼尔·M·普里戈任(Daniil M. Prigozhin)。

该研究获得了美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)和美国农业部国家食品与农业研究所(United States Department of Agriculture's National Institute for Food and Agriculture)的支持。