研究表明棉花病毒传播近20年却未被发现

美国农业部农业研究署研究人员与康奈尔大学合作者在《植物病害》杂志上发表的研究成果，挑战了关于该病毒何时以及如何在美国棉花中出现的长期假设。他们还展示了现代数据挖掘工具如何能在该病毒引起任何人关注之前很久收集的样本中，揭示出隐藏的威胁。

"棉花叶卷曲矮缩病毒（CLRDV）于2017年被正式检测到，因此假设是它最近才传入美国，"爱荷华州立大学植物病理学、昆虫学和微生物学系助理教授亚历杭德罗·奥梅多-贝拉尔德说，他曾是康奈尔大学博士后研究员。"我们的研究表明，该病毒实际上在那之前很久就已存在于美国的棉花带。我们在2006年密西西比州、2015年路易斯安那州和2018年加利福尼亚州的样本中发现了该病毒的明确证据。"

为确认研究结果，该团队于2023年在南加州进行了实地调查，收集了新鲜的棉花样本。实验室测试证实CLRDV目前存在于加利福尼亚州——这标志着该州首次正式报告该病毒。

该团队的方法在很大程度上依赖于重新分析公共基因数据库中的现有数据。通过挖掘这些数据集，研究人员发现了与当前美国毒株高度匹配的病毒序列，从而更完整地描绘了CLRDV随时间和地理的传播情况。该研究强调了维护易于访问的公共数据库对于改善未来疾病监测和防范的重要性。

一个意想不到的转折是，研究人员还在一个不寻常的地点识别出了该病毒的踪迹：加州研究人员研究的一头奶牛的胃部样本。他们的数据符合这样一个假设：该奶牛摄入了感染CLRDV的植物性动物饲料。虽然这并不表明动物被感染，但它为理解官方首次报告之前CLRDV在美国感染的时间线和范围增添了新的维度。

该研究还重新点燃了对棉花病理学中一个未解问题——青铜萎蔫病的兴趣。研究人员提出了CLRDV与青铜萎蔫症状之间的潜在联系，这一话题过去曾引发争论。"现在，随着更多研究结果与我们的发现一致，这个观点正获得关注，"奥梅多-贝拉尔德说。"这可能有助于解释长期存在的作物损失，并为未来的病毒监测策略提供信息。"

农业研究署科学家米歇尔·赫克博士解释道："对种植者而言，这些发现既是一个警示，也是一项行动号召。CLRDV在美国田间存在的时间远比任何人意识到的要长，其分布范围可能比当前报告显示的更广。理解该病毒为何能如此长时间未被察觉——以及为何现在问题日益凸显——对于制定有效的管理策略至关重要。"

该研究凸显了生物信息学、植物病理学和跨学科合作在现代农业中日益重要的作用——并表明现有数据可能早已包含我们及早发现新发威胁所需的线索。