巴塞罗那基因组调控中心(CRG)的研究人员发现,唇疱疹病毒会重塑人类基因组的三维结构,在空间上重新排列其形状,使单纯疱疹病毒1型(HSV-1)能够接触对其繁殖能力最有用的宿主基因。
该研究的第一作者埃斯特·冈萨雷斯·阿尔梅拉博士解释道:"HSV-1如同一个机会主义的室内设计师,以极高精度重塑人类基因组,并选择性接触特定片段。这是我们先前未知的病毒操控新机制,用以劫掠宿主资源。"
虽然其他疱疹病毒也被观察到会压缩和重塑宿主染色体,但尚不清楚这是否仅是病毒入侵并建立自身复制工厂的副作用。本研究首次证实HSV-1在感染数小时内即有目的地重塑人类基因组。
关键的是,研究人员发现阻断宿主单一酶类——拓扑异构酶I,能完全阻止HSV-1在感染过程中重排人类基因组的能力,从而中止这种敌对性接管。这一发现为控制这种全球感染近40亿人的病毒提供了潜在新策略。
巴塞罗那基因组调控中心(CRG)的通讯作者、ICREA研究教授皮娅·科斯玛指出:"在细胞培养中,抑制这种酶可在病毒产生任何新颗粒前彻底阻断感染。这为我们提供了阻止感染的潜在新治疗靶点。"
研究人员通过结合超分辨率显微镜(可观测20纳米宽的结构,约为发丝直径的1/3500)与Hi-C技术(揭示细胞核内DNA接触区域),获得了HSV-1劫持人类细胞机制的新发现。
研究发现敌对性接管始于感染后第一小时:病毒劫持人类RNA聚合酶II以合成自身蛋白质。随后,拓扑异构酶I(切割DNA释放扭转应力的酶类)和粘连蛋白(结构蛋白)跟随RNA聚合酶II进入新形成的病毒复制区室。
感染三小时后,大部分聚合酶及相当比例的其他两种因子已脱离人类基因。这种大规模掠夺导致宿主基因组转录全面崩溃,进而使染色质(人类基因组在细胞内的自然状态)被压缩至原有体积30%的致密外壳中。
该发现出乎意料,因为传统认为染色质结构主导转录进程。共同第一作者阿尔瓦罗·卡斯特尔斯·加西亚博士表示:"我们始终认为致密染色质会关闭基因,但此处观察到相反现象:先阻断足够转录,DNA随后发生压缩。活性与结构的关系可能是双向的。"
全球50岁以下人群中每三人就有两人携带HSV-1。感染后病毒将终身潜伏,多数病例无症状或表现为复发性唇疱疹。极少数情况下,该病毒可导致新生儿和免疫缺陷者失明或危及生命的疾病。
本研究结果有助于应对HSV-1造成的公共卫生负担——因其高流行率和反复发作特性而被视为全球健康挑战。现有疗法虽能控制症状,但耐药毒株持续增加,且目前无法根治。
Story Source:
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Journal Reference:
Esther González-Almela, Alvaro Castells-Garcia, François Le Dily, Manuel Fernández Merino, Davide Carnevali, Pol Cusco, Luciano Di Croce, Maria Pia Cosma.Herpes simplex virus type 1 reshapes host chromatin architecture via transcription machinery hijacking.Nature Communications, 2025; 16 (1) DOI:10.1038/s41467-025-60534-6
2025-06-22
2025-06-22
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2024-01-20
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