新工具有助于解读基因行为

科学家们广泛研究了遗传物质的结构和序列及其与蛋白质的相互作用，希望了解我们的遗传和环境如何与疾病相互作用。这项研究部分集中在“表观遗传标记”上，这是对DNA、RNA和相关蛋白质（称为组蛋白）的化学修饰

表观遗传标记影响基因何时以及如何打开或关闭。它们还可以指导细胞如何解释和使用遗传信息，影响各种细胞过程。因此，表观遗传学标记的变化会显著影响基因调节和细胞功能，这意味着它们可能会导致疾病。通过研究表观遗传学标记，研究人员可以阐明它们在健康和疾病中的作用，并有可能发现新的治疗途径

虽然研究人员可以识别和比较表观遗传标记，但了解特定修饰与基因工作方式之间的相关性仍然具有挑战性。为了帮助克服这一问题，Dan Ohtan Wang博士和Kandarp Joshi博士创建了一种名为epideoder的新工具。该用户友好的工具发表在《生物信息学简报》上，使生物学家能够快速检查修饰是否会影响基因在特定情况下的反应

综合细胞材料科学研究所（iCeMS）的研究员Joshi解释道：“如果发现正相关，这可能会激励科学家们证实这些发现，帮助他们了解这些基因修饰在各种疾病中的作用，包括癌症和神经疾病。”

该团队使用统计方法根据基因组的修饰次数对其进行分类。他们表明，EpidecodeR可以预测特定修饰的作用，如改变某些蛋白质或使用药物，以及这些修饰如何影响基因活性

领导这项研究的iCeMS客座教授王说：“我们使用epideoder成功预测了一种名为组蛋白脱乙酰酶的蛋白质如何影响基因的活性。”。“我们还发现epidecodeR在识别可以阻断另一种蛋白质RNA去甲基酶的物质方面是有效的，我们还探索了组蛋白的变化可能与药物滥用有关。”

研究人员计划进行进一步的研究，以提高epidecodeR的准确性和特异性。Joshi说：“我们希望包括更多关于基因在哪里、如何以及有多少修饰的细节。”。“随着数据变得越来越复杂，我们还旨在为用户提供各种统计测试，以增强该工具的功能。”