基因组研究可能是了解塔斯马尼亚魔鬼癌症耐药性的关键

在过去的30年里，澳大利亚塔斯马尼亚魔鬼种群一直饱受传染性癌症的折磨，这已将该物种推向灭绝。有袋动物极易感染魔鬼面部肿瘤疾病，这种疾病对它们的物种来说几乎总是致命的。该疾病与其宿主之间的基因组相互作用与易感动物接触病原体后感染的速度有关

通过对动物及其肿瘤进行DNA测序，USF综合生物学助理教授Mark Margres和博士生Dylan Gallinson追踪了魔鬼与癌症之间的基因组相互作用。他们的发现发表在《美国国家科学院院刊》上的一篇合著论文《塔斯马尼亚魔鬼与传染性癌症共同进化的基因组间特征》中

“生物学中的一个大问题是疾病的遗传基础。确定这一点的经典方法是通过基因组研究和回归分析，将基因与疾病风险相匹配，”Margres说。“以前还没有研究两个基因组之间相互作用的技术。”

使用最近开发的全基因组联合研究，Margres和Gallinson评估了960个基因组和15年捕获魔鬼的数据，以跟踪魔鬼和癌症的共同进化

Gallinson说：“我们在塔斯马尼亚的合作者一直在监测疾病的传播并收集组织样本。”。“我们对肿瘤和魔鬼的DNA进行了测序，以找到导致疾病表现的突变。”

他们的发现可以为追踪传染病的流行病学模型和专注于拯救濒危物种的魔鬼管理策略提供信息