单细胞RNA测序取得突破，推动植物生物学发展

最近在单细胞RNA测序（scRNA）方面的突破，如最近开发的“RevGel-seq”方法，已经彻底改变了植物细胞分析。这项技术独立于特殊仪器，简化了原生质体分离过程，解决了原生质体的分离难题

现在，一个跨国研究团队回顾了这一点和植物scRNA测序的其他最新进展，旨在为促进不同植物样品的scRNA方法的适当选择提供指导。他们的评论文章发表在《生物设计研究》杂志上

在植物生物学的世界里，理解单个植物细胞的复杂性是一个复杂的挑战，特别是由于这些细胞被刚性细胞壁包裹的独特结构。这一挑战反过来阻碍了完整细胞核或原生质体的分离，而这对深入分析至关重要

现在，尽管传统的RNA测序在帮助研究人员理解植物细胞的复杂性方面发挥了重要作用，但单细胞RNA（scRNA）测序的发展使我们对植物生物系统的理解和分析取得了突破性进展

此外，scRNA测序的其他技术进步，如细胞分离、文库制备和测序技术的开发，进一步提高了研究人员在分析中克服植物特异性挑战的能力。尽管过去的研究已经回顾了scRNA测序的实用性和实用性，但没有多少人试图研究scRNA测序方面的技术发展

在最近的综述文章中，研究人员全面研究了植物系统生物学的最新进展和范式转变。植物系统具有复杂的细胞结构，需要创新的方法来解开隐藏在植物细胞内的秘密。这篇综述捕捉了scRNA技术的最新发展，并讨论了该领域的挑战和未来的潜在机遇

这篇综述首先讨论了单细胞转录组学中常用的方法，包括实验和计算成分，还阐述了scRNA测序的一般工作流程。鉴于原生质体制备和细胞核分离方法的挑战和局限性，微流体平台的使用为单细胞分离、分离和分析提供了主要的工作流程

虽然植物scRNA测序的原生质体和细胞核之间的选择取决于研究目标，但该综述敦促研究人员在确定最合适的方法时，仔细考虑多种因素的选择，如研究目标、植物物种和其他权衡

该综述随后谈到了scRNA测序文库构建和测序的进展，强调了重大成就，如Nextera XT DNA文库制备试剂盒、BD Rhapsody系统和Illumina测序技术。接下来，研究人员讨论了scRNA测序所涉及的多个步骤，然后继续讨论scRNA数据库的最新发展

然后，作者讨论了研究人员为解决植物scRNA数据库的局限性所做的改进，如“scPlantDB”，这是一个由He等人创建的综合数据库，覆盖了17种植物物种的约250万个细胞

研究人员继续讨论scRNA测序在植物系统生物学中的应用，并详细阐述了scRNA测序如何被用于在细胞水平上研究植物生物学，揭示了植物发育的分子机制、植物对生物和非生物胁迫的反应、植物的表观遗传调控、细胞命运决定和器官发生，等等

在讨论scRNA测序进一步发展的挑战和潜力时，研究人员强调了最近的一项突破性进展，旨在优化原生质体分离方法，并在不同实验室建立标准化的单细胞RNA测序（scRNA-seq）过程

该开发采用了多方面的方法，试图将创新的scRNA-seq技术与传统方法相结合，以应对复杂的植物细胞世界。样品制备成为一个细致的过程，重点关注酶处理持续时间、温度和渗透势等变量

值得注意的是，该研究探索了新的scRNA-seq技术，包括RevGel-seq，该技术最初是为动物系统开发的，但现在被引入植物研究领域

橡树岭国家实验室这篇综述的首席研究员杨晓涵博士解释道，“RevGel-seq是最近在scRNA-seq方法上取得的突破，它真正改变了游戏规则。与在样品制备过程中依赖特定单细胞RNA仪器的传统方法不同，RevGel-seq对细胞条形码珠复合体进行操作。

”这种在人和小鼠细胞中制备scRNA-seq的创新样品不仅方便而且高效。“

RevGel-seq还消除了对特定仪器的需求，为不同时间或地点的样本采集和处理提供了灵活性。不用说，结果超出了预期，展示了RevGel-seq重塑植物研究中单细胞RNA测序方式的潜力。

本综述中列出的最新进展具有重要意义离子对植物生物学的未来。而scRNA酶