随着基因组测序技术的发展,在水果和蔬菜中发现了许多长的非编码RNA。对lncRNA的广泛研究揭示了它们在转录和转录后水平上调节蛋白质编码基因表达的作用,从而在水果和蔬菜的生长、发育和应激反应中发挥关键作用
发表在《园艺研究》上的一篇新综述全面总结了目前对水果和蔬菜中lncRNA的形成、功能特征和调节机制的理解
根据其相对于蛋白质编码基因的转录方向和位置,lncRNA可分为四种类型:基因间lncRNA(lincRNA)、长非编码反义转录物(lncNAT)、有义lncRNA和内含子lncRNA。本文从lncRNA的丰度和大小、结构和定位、衰变和进化三个方面介绍了lncRNA在水果和蔬菜中的形成及其基本特征
最近的研究报告全面总结和讨论了lncRNA在水果和蔬菜中的作用,涵盖了色素积累、生殖器官发育、果实成熟以及对营养缺乏、盐、干旱、温度和病原菌的反应等各个方面。此外,作者还阐明了lncRNAs在基因转录调控和选择性剪接中的调控机制,以及lncRNA与植物激素、转录因子和miRNA之间的相互作用
高通量测序技术的发展极大地提高了发现、预测和鉴定lncRNA的能力。然而,植物数据库中与水果和蔬菜中的lncRNA相关的全面lncRNA分析数据仍然稀缺,阻碍了lncRNA表达和定位的表征
此外,与lncRNA亚细胞定位实验(如FISH)相关的成本对lncRNA研究构成了限制,这突出表明迫切需要开发更经济实惠的lncRNAs研究方法
对lncRNA在果蔬作物中的功能和机制的探索仍处于早期阶段,技术的快速发展将为lncRNA研究在果蔬中的应用带来新的机遇和突破
Journal information: Horticulture Research
Provided by Chinese Academy of Sciences
2024-09-15
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