研究表明，全球南方的医疗保健做法有助于抗菌药物耐药性在世界各地的传播

许多对多种抗生素具有耐药性的细菌起源于巴基斯坦和印度次大陆的其他地区。由这些细菌引起的感染很难治疗；需要使用广谱抗生素进行更长时间的治疗，尽管如此，感染多重耐药性细菌的患者的死亡率仍在增加。

发表在《自然通讯》上的一项研究揭示了巴基斯坦人群中抗微生物耐药性的普遍性。赫尔辛基大学和剑桥威康桑格研究所进行的这项多学科研究还调查了抗生素使用对个体患者耐药细菌发生的短期影响

赫尔辛基大学传染病教授、赫尔辛基大学医院高级医疗官Anu Kantele表示：“从印度次大陆返回的旅行者携带多重耐药细菌的风险最高。为了了解全球耐药性的出现，有必要探索在这些高风险地区传播的耐药菌株。”

鉴定了整个细菌培养物中的基因

研究人员从拉合尔大都会区一家小医院预约的大约1000名患者身上采集了直肠拭子样本。大约一半的患者在一个月的监测期后提供了对照样本

研究人员使用这些样本来探索抗生素使用对人类携带的大肠杆菌的影响。还从巴基斯坦人口最多的旁遮普省的健康志愿者身上采集了样本

传染病医生Tamim Khawaja在巴基斯坦花了四个月的时间从当地人那里收集样本。这些细菌在当地实验室进行现场培养，并将细菌培养物冷冻并运送到芬兰

与Wellcome Sanger研究所合作，使用一种新的深度测序方法对培养物的DNA进行测序。该分析是使用赫尔辛基大学博士后研究员Tommi Mäklin开发的新方法进行的，通过该方法可以准确使用DNA中包含的所有信息。因此，该研究联盟能够识别大肠杆菌的多样性，无论是在个体还是在群体层面

“由于最新测序技术和我的团队开发的方法具有更好的可扩展性，我们对细菌和耐药性的进化动力学研究打开了一个不同的视角。我相信这种方法将帮助我们在未来几年实现几项突破，”Jukka Corander教授说

研究表明，在巴基斯坦发现的大肠杆菌菌株的流行率表现出显著差异，即使是从单个个体采集的样本也是如此。研究人员还观察到，许多在欧洲常见的细菌菌株无法与巴基斯坦的当地菌株竞争，尽管在两大洲都可以发现许多菌株

“例如，ST58，一种在巴基斯坦常见的大肠杆菌菌株，在生活水平高的国家引起了严重的感染。在西方国家，这种菌株的无症状携带者很罕见，但在巴基斯坦，ST58是第三常见的定居在人群中的大肠杆菌。同样，某些导致尿路感染并由西方国家的健康人无症状携带的大肠杆菌毒株在巴基斯坦很罕见，可能是因为抗生素选择压力大，”Mäklin说

没有抗生素以防万一

在巴基斯坦发现的一些大肠杆菌在基因上与之前在挪威测序的菌株接近

Kantele说：“这非常能代表细菌如何像人类一样迅速地从一个大陆传播到另一个大陆。”

“在西方国家，仅仅减少不必要的抗生素使用是不够的；帮助贫穷国家更明智地使用抗生素符合每个人的最大利益。在我们的研究中，我们意识到医生通常每个病人的时间不到一分钟，导致经常开广谱抗生素以备不时之需。卡瓦贾说，在我们的医疗保健危机中，我们经常忘记危机在贫穷国家要严重得多，它的影响也波及到我们。”

这项研究是他博士论文的一部分