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研究揭示了对健康布里斯班河至关重要的微生物

本站发布时间:2024-06-30 07:03:14

一种独特的河流健康监测方法发现了一支为保护布里斯班河而战斗的微小生物大军

昆士兰大学博士候选人Apoorva Prabhu和名誉副教授Chris Rinke领导了一个团队,在12个月的时间里对布里斯班河3个地区数千种微生物的DNA进行了采样、测序和评估

该团队的研究发表在《ISME通讯》杂志上

对近2500种不同类型的微生物基因组进行了采样和鉴定,其中许多属于以前未经探索的物种,形成了亚热带河口有史以来最大的微生物基因组数据库

“直到现在,布里斯班河中微生物多样性的完整程度还不得而知,”Prabhu女士说。“微生物是我们水道健康状况的一个方便指标。它们是高效的营养回收器,处理碳、氮、磷和硫。

”不幸的是,在我们位于Indoroopilly、Eagle Farm和Moreton Bay Shorncliffe的布里斯班河收集点,我们发现了大量以硝酸盐或磷等营养物质为食的微生物,这表明农业径流等人类活动造成了严重污染

“特别是,我们命名为布里斯班富营养菌的一种新细菌被证明是硝酸盐和磷含量升高的重要指标。每当我们遇到这种细菌时,河流中的营养水平就会飙升,不幸的是,现实是,当这些微生物保持良好的营养时,河流却在遭受痛苦。”

该团队使用先进的宏基因组学(一种旨在研究整个微生物群落的方法)和机器学习技术来识别大量新微生物

Prabhu女士说:“值得注意的是,我们发现的80%以上的微生物对科学来说是全新的,这突出了布里斯班河下游以前未经探索的巨大多样性。”。“这些知识对于制定有效的环境监测和管理策略至关重要,因为它具体地告诉了我们的水道面临的最紧迫的问题是什么,即污染。”

Rinke博士说,这项研究为河口环境中的微生物生态学研究树立了一个基准,尤其是在布里斯班等亚热带和热带地区

Rinke博士说:“宏基因组学和机器学习的结合为探索微生物群落及其生态功能提供了一个强大的框架。”

“未来的研究可以在这些发现的基础上进一步解释微生物生态系统内的复杂相互作用及其对环境变化的反应。我们的下一个目标是关注洪水对微生物群落的影响。我相信布里斯班河的浑水中隐藏着更多的秘密。”

该团队要感谢昆士兰大学化学与分子生物科学学院和昆士兰大学微生物组研究中心的研究人员的贡献

More information: Apoorva Prabhu et al, Machine learning and metagenomics identifies uncharacterized taxa inferred to drive biogeochemical cycles in a subtropical hypereutrophic estuary, ISME Communications (2024). DOI: 10.1093/ismeco/ycae067

Provided by University of Queensland

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