小鼠研究解锁肠道细菌的基因组编辑

Eligo Bioscience是一家专注于解决由微生物组细菌基因表达驱动的疾病的基因编辑公司，该公司在《自然》杂志上发表了一项研究，该研究解锁了肠道细菌的基因组编辑

自20世纪70年代基因疗法问世以来，最近批准了第一批基于CRISPR的药物，研究人员在将DNA传递到各种细胞类型和器官以纠正遗传缺陷方面取得了重大进展。然而，到目前为止，人类携带的大部分基因仍然完全无法触及：微生物组

由数十亿共生细菌组成的微生物组对我们的健康和免疫系统的正常运作至关重要。然而，我们发现越来越多的细菌基因与慢性和严重疾病有关：从可以引发自身免疫性疾病的细菌肽到导致炎症性疾病、肿瘤形成和神经退行性疾病的菌株毒力因子

随着越来越清楚的是，影响微生物组组成的非靶向疗法会导致严重的不良事件和副作用，开发以靶向方式编辑微生物组的新方法至关重要

“Eligo Bioscience所取得的成就表明，现在可以对肠道中细菌的DNA进行特定的改变，类似于科学家编辑人类基因以研究或治疗遗传疾病的方式，”Eligo Bioscience的联合创始人、巴黎巴斯德研究所的研究员David Bikard说

在一次精彩的展示中，Eligo展示了设计、生产和纯化噬菌体衍生衣壳的能力，该衣壳含有编码碱基编辑系统的合成DNA有效载荷

小鼠口服给药后，衣壳以极高的效率和精度递送有效载荷，以靶向小鼠肠道中数百种细菌中的细菌群。值得注意的是，该系统可以通过在相应基因中产生单碱基对突变来精确灭活抗生素抗性基因或毒力因子

当针对在小鼠肠道定植的大肠杆菌菌株时，该技术修改了90%以上细菌的靶基因，在某些情况下高达99.7%。这些变化至少在42天内保持稳定

Eligo技术副总裁、该研究的资深作者Jesus Fernandez强调了“这一成就是Eligo Bioscience团队八年工作的结晶，代表了微生物组研究的范式转变。这一飞跃为Eligo在开发新型遗传药物和寻找新靶点方面提供了行业内的独特优势。我们现在终于有了一个工具来探究特定细菌基因在健康和疾病中的作用。”

“这项技术增强了Eligo在微生物组体内编辑工具方面的开创性武器库，拓宽了基因编辑领域可寻址治疗靶点的前景，”Eligo首席执行官兼联合创始人Xavier Duportet说。Eligo More information: Andreas K. Brödel et al, In situ targeted base editing of bacteria in the mouse gut, Nature (2024). DOI: 10.1038/s41586-024-07681-w

Journal information: Nature