破解梨基因组：学生如何帮助解锁梨产业的新工具

梨是美国西北太平洋地区的大生意。但你知道吗，几个世纪以来，传统的梨育种基本上没有改变

这一缓慢的过程既困难又昂贵，需要劳动力、材料和土地空间资源的长期投入。然而，传统的梨育种可能会从基因组学中得到一些帮助，这要归功于学生、科学家和梨产业之间通过一项名为“美国校园树基因组学”（ACTG）的倡议进行的独特合作

ACTG诞生于两位教授纪念奥本大学标志性的图默橡树的愿望，这些橡树在2010年奥本大学足球赛季中中毒。他们的计划是：对橡树的DNA进行测序，并创建第一个活橡树参考基因组。为了增加趣味性，他们决定开设一门为期一学期的课程，让真正的奥本学生能够参与对奥本橡树进行测序

ACTG联合创始人Alex Harkess博士表示：“ACTG利用标志性的、具有经济价值的树木来弥合学生与尖端基因组学之间的差距。”

其他机构可以利用自己的校园树作为科学和教育努力的跳板来复制这种经验

ACTG正在颠覆传统的学术模式，为学生提供进入基因组研究世界的独特切入点。该倡议超越了教科书学习，让参与者沉浸在组装、分析树木基因组并在受人尊敬的科学期刊上发表的实际过程中

本课程的学生可以通过HudsonAlpha的专家获得尖端的基因组测序技术和生物信息学技能。通过从事具有实际成果的真正研究项目，学生们获得了信心和经验，在不断发展的基因组学领域塑造了他们成功职业的轨迹

“这门课程对学生和受训者来说是一个很好的机会，他们不仅可以与一个全新的想法互动，而且无论他们的技能水平如何，都可以熟练掌握它。我以前没有生物信息学的经验，我提出了一套全新的、极具市场价值的技能，”参加梨基因组课程的奥本大学23届毕业生哈里森·埃斯特斯说。他目前是威斯康星大学的研究生，并认为ACTG课程帮助他实现了这一目标

对学生参与的重视超越了技术培训。ACTG积极解决STEM进入和坚持的障碍，为无法获得先进技术的个人提供宝贵的机会。ACTG团队寻求小型大学和学院、社区和初级学院以及缺乏成熟遗传学和生物信息学培训渠道的重型作战单元的参与

ACTG的变革力量不仅仅是为学生提供宝贵的技能和经验。通过深入研究现实世界的研究项目，ACTG参与者将他们的知识转化为实际应用，直接造福于科学界和具有重要经济意义的行业

就梨产业而言，ACTG倡议中的一组奥本学生与华盛顿州立大学和美国农业部农业研究所的梨专家合作，创建了一个高质量的梨基因组。ACTG学生的细致工作产生了一个全阶段的染色体量表组装，这比之前的工作有了重大进步

发表在《G3：基因、基因组、遗传学》上的d'Anjou基因组汇编揭示了数千种基因组变异，这些变异对梨的育种工作非常重要。这种高质量的资源为梨种植者打开了一个信息宝库。新的基因组组装也是研究梨进化、驯化和分子育种的重要工具

华盛顿果树研究委员会执行主任Ines Hanrahan博士说：“ACTG：美国校园树木基因组计划不仅为一种有价值的梨品种建立了高质量的基因组资源，最终将使种植者和消费者都受益，而且还教育了近20名学生和科学家了解苹果和梨行业的需求。”