G-四链体(G4)是DNA和RNA中的特殊结构,在细胞中起着至关重要的作用,与癌症和神经疾病有关。香港城市大学(城大)的一个研究小组最近建立了一个新的平台来选择可以靶向功能性G4结构的L-RNA适体
他们发现了一种名为L-Apt12-6的L-RNA适体,它与G4结构的特定拓扑结构特异性结合:平行G4。这些发现可能有利于开发G4相关疾病(如癌症)的新药和治疗方法
这篇题为“使用L-RNA适体选择性靶向平行G-四链体结构”的论文在线发表在《核酸研究》上
传统工具,如小分子配体、抗体和肽,已被用于靶向G4。然而,它们中只有少数能够与特定的G4构象相互作用。此外,这些工具在基因调控中的应用,特别是在内源性基因水平上的应用,还没有得到广泛的研究,因此存在着显著的研究和知识差距
为了克服这个问题,重要的是要建立通用的平台和新的工具,专门针对感兴趣的特定G4构象
城市大学化学系副教授Kwok Chun-kit教授表示:“作为一种非天然的D-核糖核酸对映体形式,L-核糖核酸适体是一种很有前途的核酸靶向新工具,但其开发仍处于早期阶段,迄今为止只研究了有限数量的功能性核酸靶点。”
“在这项研究中,我们首次引入了一种创新的高通量L-RNA适体选择方法,即‘G4 SELEX Seq’,这使我们能够鉴定一种新的L-RNA适配体L-Apt12-6。与其他G4拓扑结构和核酸结构相比,它与平行G4强而特异地结合,”Kwok教授说。
“这是第一个能够靶向DNA G4的L-RNA适体,特别是在平行G4构象中。重要的是,我们还证明了L-Apt12-6可以控制原原癌基因c-kit1在癌症细胞中的基因表达。“
”我们花了一年多的时间对适体选择平台进行故障排除和改进,以获得L-Apt12-6。SELEX过程中的非特异性富集阻碍了结合序列的选择,”这项工作的第一作者、现任Kwok教授实验室博士后研究员吉丹阳博士补充道,“Kwok教授说。
新发现的L-RNA适体L-Apt12-6作为G-四链体构象的选择性结合物具有重要价值。它可以在体外和细胞内调节G4介导的基因活性。研究人员说,L-Apt12-0可以通过连接蛋白质、肽、核酸或配体等各种功能模块进行进一步定制,使其能够在生物医学和生物技术领域等广泛应用
Provided by City University of Hong Kong
2024-09-15
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