水蚤是一种微小的甲壳类动物,或称“水蚤”,对环境的适应能力极强。这是由于它们显著的表型可塑性,即尽管它们的基因构成保持不变,但它们仍有能力改变自己的形态或行为。即使是雄性和雌性水蚤在基因上也是相同的
现在,大阪大学的一个小组通过结合两种不同的RNA测序技术,揭示了某些基因在雄性和雌性水蚤中产生不同版本或异构体的蛋白质,从而揭示了这一现象
表型可塑性允许单个基因组产生不同的“表型”,这意味着水蚤可以在生理上适应盐度、温度、捕食者的存在等方面的变化
《科学报告》发表了题为“单性生殖甲壳类动物大型水蚤的基因亚型鉴定及其雄性和雌性胚胎之间的转换事件”的文章
一种名为RNA的分子是由一个称为转录的过程中的基因产生的,转录为细胞机制提供指令,然后制造相应的蛋白质。转录后RNA的变化可能导致单个基因产生多种异构体或略有不同的RNA分子
这种异构体变体很难研究,因为大多数RNA测序技术只读取很短的RNA分子片段,然后依靠计算技术将序列重新拼接在一起。这意味着不同异构体的精细细节丢失了
然而,在一种新的方法中,该团队首先使用一种名为Iso-Seq的较新的长读RNA测序方法来精确识别大型水蚤物种中存在的所有不同亚型,然后使用高度准确的短读RNA序列缩小雄性和雌性之间发生的亚型的特异性转换
第一作者加藤康彦解释道:“单凭短读测序无法揭示这些信息。”。“这种新的方法,结合长读和短读测序,揭示了以前未知的达芙尼亚转录的细微差别。”
资深作者渡边Hajime补充道:“我们确定了以性别依赖的方式转换特定亚型表达的基因。”。“这为深入了解瑞香独特表型可塑性的生物学机制提供了依据。”
这项研究揭示了瑞香这一生态重要物种两性异形的分子基础,并为了解环境条件如何决定该物种的性别提供了工具。因此,这些发现为甲壳类动物水产养殖的进一步发展开辟了道路
Journal information: Scientific Reports
Provided by Osaka University
2024-09-15
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2024-09-15
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