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科学家对澳大利亚毕尔巴鄂的全基因组进行测序

本站发布时间:2024-07-02 20:02:10

在食肉狐狸和猫的压力下,以及与野生兔子的竞争下,大比尔比已经失去了80%以上的栖息地。Carolyn Hogg教授领导的保护工作旨在帮助拯救白暨豚免于灭绝

悉尼大学领导的一个科学家联盟首次对澳大利亚比尔的整个基因组进行了测序。这项研究发表在《自然生态与进化》杂志上

这是首次绘制比尔比的基因蓝图,包含了它们如何生长和进化的生物信息,为保护受威胁物种提供了重要工具

与其他有袋动物相比,bilbies鲜为人知,通常被称为澳大利亚复活节兔子,对澳大利亚原住民社区具有持续的文化意义

值得注意的是它们的大耳朵和向后的袋子,比尔是夜间穴居的杂食动物。它们用强壮的前肢和长爪寻找食物,翻转土壤和有机物,成为澳大利亚沙漠的生态系统工程师

曾经有两种白暨豚,小白暨豚在20世纪60年代灭绝,大白暨豚现在只存在于其以前栖息地范围的20%,主要分布在西澳大利亚和北领地的中部沙漠中

在欧洲人到来、引入野猫和狐狸以及兔子争夺食物来源后,毕尔巴鄂的数量急剧下降。比尔比种群通常由土著护林员在野外管理,而大约6000只生活在围栏保护区、岛屿和动物园中

悉尼大学的Carolyn Hogg教授领导的一个团队使用一只已故动物园比尔比的DNA对幸存的大比尔比的基因组进行了测序。该团队还从1898年采集的一个标本的头骨中创建了已灭绝的小比尔的第一个基因组。澳大利亚野生动物基因组学小组的霍格教授说:“大比尔参考基因组是迄今为止质量最高的有袋动物基因组之一,分为九个部分,代表每个比尔染色体。”。“它提供了对生物学、进化和种群管理的见解。”

参考基因组相当于有一个拼图盒子的盖子;这是一种了解所有DNA拼图意味着什么的方法

霍格教授说:“这有助于我们了解是什么赋予了比尔独特的嗅觉,以及它们是如何在没有饮用水的情况下在沙漠中生存的。”

大比尔比基因组包括9条染色体上约38000个蛋白质编码基因,具有36.6亿个碱基对。相比之下,人类基因组在23条染色体上有大约19900个蛋白质基因,有32亿个碱基对

重要的是,基因组正被用于管理动物园、围栏保护区和岛屿中的比尔比集合种群

“通过选择迁移和释放的个体,我们最大限度地提高了它们的遗传多样性,从而提高了种群适应不断变化的世界的能力。”

该团队还利用基因组开发了一种更精确的粪便检测方法,以补充土著护林员现有的传统土地利用做法

西澳大利亚Kiwirkurra土著保护区的护林员Scott West说:“我们对bilbies了解很多——它们住在哪里,吃什么,以及如何追踪它们。”

“用iPad绘制地图,用相机监测它们是很好的。DNA工作还有助于检查bilbies是否有亲缘关系,它们来自哪里,以及它们走了多远。将旧方法和新方法结合起来,有助于我们获得关于bilbies以及如何照顾它们的良好信息。这就是双向科学。”

霍格教授说:“如果没有参考基因组,一切都需要四倍的时间,而且困难四倍。”。“我们已经加快了科学研究,以确保比尔比尔的持续生存。”

More information: Carolyn J. Hogg et al, Extant and extinct bilby genomes combined with Indigenous knowledge improve conservation of a unique Australian marsupial, Nature Ecology & Evolution (2024). DOI: 10.1038/s41559-024-02436-2

Provided by University of Sydney

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