白栎(Quercus alba)在经济、生态和文化上都具有很高的价值,是一种重要的森林物种,也是北美东部大部分地区最丰富的树木之一。在其分布的许多地区,它还面临着幼苗补充减少的问题
在《新植物学家》发表的一篇论文中,代表田纳西大学农业研究所、印第安纳大学、肯塔基大学、美国林务局和其他几个机构的研究人员首次描述了该物种的复杂基因组,为植物进化、树木育种和遗传改良工作的基本问题提供了见解,这可以帮助森林管理者规划和解决未来的森林资源问题
该论文的主要作者,德克萨斯大学昆虫学和植物病理学系生物信息学和计算基因组学副教授Meg Staton和印第安纳大学国家科学基金会博士后Drew Larson,与全国学术界、美国林务局、州森林和工业界的同事协调,以获得代表该物种的遗传序列数据
这项工作的核心人物还有肯塔基大学园艺教授兼詹姆斯·B·比姆肯塔基州烈酒研究所所长赛斯·德博尔特,以及美国林务局南方研究站兼肯塔基大学森林健康研究与教育中心主任达纳·纳尔逊
Staton和她的合著者在这篇论文中说:“白橡木基因组是研究栎属植物基因组多样性和进化的主要新资源。此外,无偏基因注释是准确评估栎属植物抗病基因进化的关键。”这篇论文探讨了白栎属植物的遗传多样性和种群分化程度,以及基因含量和抗病基因在栎属和相关类群历史上是如何进化的。作者还讨论了全基因组数据支持的系统发育假说——橡树物种是如何进化相关的
该研究指出,现存遗传变异的数量和种群在当地的适应程度将影响白栎和其他白栎物种对日益普遍的高温和干旱胁迫的反应。这项研究的细节对于那些在经济、生态和文化边界上投资白橡木可持续性的人来说很有意义
More information: Drew A. Larson et al, A haplotype‐resolved reference genome of Quercus alba sheds light on the evolutionary history of oaks, New Phytologist (2025). DOI: 10.1111/nph.20463Journal information: New Phytologist
Provided by University of Tennessee at Knoxville
2025-03-15
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