康奈尔大学鸟类学实验室的Emily Jane McTavish教授及其同事绘制了每种已知鸟类的进化图。
他们结合了1990年至2024年间近300项研究中发表的9239种鸟类的数据和另外1000种鸟类的精选数据,创建了一个完整的鸟类进化树。随着更多研究的发表,由此产生的数据库可以很容易地共享和更新。麦克塔维什说:“人们喜欢鸟类,很多人都在研究鸟类。人们一直在发表关于鸟类进化关系的科学论文。”。“我们综合了所有数据,将统一的信息放在一个地方。”
研究人员在《美国国家科学院院刊》上发表的一篇论文中详细介绍了他们是如何创建这张进化图的。作者写道,合成树可以帮助了解有关鸟类进化和生态学的各种研究问题。此外,用于生产这种树的方法也可用于其他类型的动植物。
该项目始于大约四年前,当时康奈尔大学实验室的Eliot Miller联系了McTavish,他为生命之树(OpenTree)项目开发软件已有大约十年的时间。米勒说:“每年都有数十种鸟类系统发育学(使用遗传学研究进化史)发表,但他们的发现——从分类学到我们对祖先特征的理解——不一定用于下游研究。”。
“我们的项目应该有助于结束这一研究循环,以便这些研究及其发现更好地纳入后续研究。”
McTavish说,尽管在米勒邀请她合作之前,她还没有见过米勒,但这个项目与她继续的工作完美契合。
>“艾略特真的很喜欢鸟类,实验室里有很多鸟类专家,他们还开发了Merlin和Ebird等观鸟应用程序,所以这是他们的一方,我一直在开发这个软件来结合进化树,所以这就是我的一方。”她解释道。OpenTree是一个合作项目,它汇集了进化生物学家和分类学专家,建立了一个准确、全面的进化树,描述了地球上每个命名物种是如何相互关联的。它基于类似维基的模型工作,允许用户手动上传数据以更新树的进化关系。McTavish解释说,随着对关系的新理解的出现,用户可以将这些信息添加到生命树中,以确保它反映了对物种之间进化关系的最新理解。
开放生命树中现在有250多万个物种,由于基因组测序的进步,新的数据不断涌入,自然科学学院生命与环境科学系的生物学家McTavish和一位合作者一直在编写软件,在数据出现时自动更新树。
她说鸟类物种综合填补了《开放之树》中的又一个空白。p
Journal information: Proceedings of the National Academy of Sciences
Provided by University of California - Merced
2025-05-13
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