海洋细菌Alcanivorax borkumensis以石油为食,在石油泄漏后迅速繁殖,从而在许多情况下加速了污染的消除。它通过生产一种“有机洗碗液”来实现这一点,并用它来附着在油滴上。
来自波恩大学、亚琛工业大学、杜塞尔多夫海因里希·海涅大学和Forschungszentrum Julich研究中心的研究人员现在发现了这种有机液体的合成机制。
该研究结果发表在《自然化学生物学》上,可以培育出更有效的石油降解细菌菌株。
粗略地翻译成英文,这种细菌的拉丁名是“Borkum的食烷烃者”。事实上,这个名字说明了一切,因为烷烃是大量存在于石油中的碳氢化合物链。A.borkumensis以海洋中天然存在的富含能量的链为食,也以分散在石油泄漏中的非天然链为食。在许多情况下,细菌会迅速繁殖,从而加速污染清除过程。
油和水不能混合众所周知,油和水不会混合,为了吃它最喜欢的食物,这种微小的海洋生物需要化学物质的帮助。它为自己制造了一种天然的洗碗液。这种“洗涤剂”是一种由氨基酸甘氨酸和糖脂肪酸化合物组成的化合物。
波恩大学IMBIO研究所(植物分子生理学和生物技术研究所)的生物化学家Peter Dormann教授解释说:“这些分子有一个水溶性部分和一个脂溶性部分。”。“细菌沉积在油滴的表面,在那里形成生物膜。”
直到Forschungszentrum Julich和Heinrich Heine University Dusseldorf的Karl Erich Jaeger教授领导的一个工作组深入研究了这种细菌的基因组,才了解了食烷烃者合成这种洗涤剂的机制。“在我们的研究中,我们发现了一个基因簇,我们认为它可能在分子的产生中发挥作用,”Jaeger教授解释道。事实上,当这个集群的基因被关闭时,细菌附着在油滴上的能力受到了损害。亚琛工业大学的Lars Blank教授说:“因此,它们吸收的油更少,生长也慢得多。”。
潜在的生物技术应用Dormann教授的博士生Jiaxin Cui最终成功地阐述了a.borkumensis生产洗涤剂的合成途径。这一过程涉及三种酶,其中分子是逐步组装的。这三个基因包含构建这些生物催化剂的指令,没有这些指令,键合过程就无法有效进行。
“我们成功地将相关基因转移到另一种细菌中,然后这种细菌也会产生洗涤剂,”崔解释道。
像A.borkumensis这样的细菌对降解石油污染很重要,因此这些发现具有重要意义,可能会导致新的、更有效的菌株的开发。波恩大学跨学科研究区(TRA)“可持续未来”的成员Dormann说:“这种天然洗涤剂也可以用于生物技术应用,例如从碳氢化合物中微生物生产关键化合物。”
Journal information: Nature Chemical Biology
Provided by University of Bonn
2025-05-13
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