North Carolina State University researchers used text analytics on both historic and modern writing to reveal more information about the effects and spread of the plant pathogen—now known as Phytophthora infestans—that caused the 1840s Irish potato famine
北卡罗来纳州立大学的研究人员对历史和现代文字进行了文本分析,以揭示更多关于植物病原体(现在被称为晚疫病)的影响和传播的信息。这种病原体导致了19世纪40年代的爱尔兰土豆饥荒,并继续困扰着土豆和番茄的饲养者
这项研究将1843年至1845年的历史农场报道、新闻报道和美国专利局农业记录数字化后,研究了“土豆腐烂”和“土豆病”等关键词,以显示病原体是如何在1845年爱尔兰发生毁灭性饥荒之前首先在美国东北部传播的。这项研究还使用文本分析来追踪社交媒体上关于晚疫病现代传播的信息
研究人员表示,文本分析有望成为一种有用的工具,帮助研究人员追踪和可视化历史和当前的植物疾病“我们回到了对美国马铃薯疾病爆发的最初描述,因为它们发生在1843年至1845年之间,在欧洲爆发之前,”北卡罗来纳州立大学植物病理学杰出教授、《科学报告》上一篇描述该研究的论文的通讯作者Jean Ristaino说
“我们通过关键字搜索这些描述,通过这样做,我们能够使用文件中提到的位置坐标重新创建原始疫情地图。
”我们还试图了解人们当时对这种疾病的看法以及它的来源。“
该分析记录了1843年至1845年间马铃薯晚疫病传播到美国东北部其他地区和加拿大之前,纽约州、特拉华州、马萨诸塞州、新泽西州和宾夕法尼亚州五个州马铃薯上的晚疫病。这种病原体后来对欧洲,尤其是爱尔兰造成了严重破坏
该论文还研究了2012年至2022年的推文,以了解更多关于感染p.infestans现代传播的信息。他们在推特上挖掘病原体的常见名称和科学名称,并能够定位来源
Ristaino说:“社交媒体挖掘很有趣,因为我们发现大多数谈论这种疾病的人都是发达国家的科学家,他们在推特上宣传自己的工作。”。“同样有趣的是,多年前出现这种疾病的州现在仍然有这种疾病。”这项研究还使用谷歌Ngram搜索词揭示了一个令人惊讶的发现。研究人员在20世纪50年代的文献中发现了晚疫病的激增。深入研究文件中引用的相关学术文献,Ristaino发现了二战后美国番茄大规模晚疫病爆发的证据
Ristaino说:“这可能是一种新的北美病原体菌株的出现,被称为U.S.1,在那之后变得非常广泛。”Ristaino补充说,她和她的团队计划继续这类工作,并将分析工具扩展到其他植物病虫害