由于它的大耳朵和跳跃动作,通常被称为澳大利亚的“复活节兔子”,大比尔比(Macrotis lagotis)是最后一种。今天,我们公布了它的参考基因组——全部36.6亿个片段。
发表在《自然生态与进化》杂志上,它是迄今为止最大的有袋动物基因组。它不仅比考拉的基因组还大,甚至比人类的基因组还要大
基因组是一整套DNA——生命的组成部分——保存着物种的遗传密码。那么,什么是参考基因组,为什么它有用呢
参考基因组是研究一个物种生物学的参考点。这就像拼图盒子的盖子:没有它,你可以花时间和耐心找出碎片的去向。有了它,当你知道每一块是什么以及它去了哪里时,谜题就会很快出现
新的参考基因组可以告诉我们更多关于毕尔巴鄂生物学和进化的信息,比如哪些基因与它们敏锐的嗅觉有关,或者它们如何在干旱地区生活时新陈代谢缓慢
重要的是,基因组使我们能够构建新的保护工具,帮助管理人员和护林员拯救这种独特的澳大利亚物种
一个文化上重要的物种,毕尔巴鄂不仅仅是它们独特的生物学。它们对澳大利亚原住民具有重要的文化意义,在全国各地都有许多原住民的名字。我们称大比尔比为尼努,这是我们合作过的西澳大利亚吉布森沙漠Kiwirkurra社区使用的名称。不幸的是,尼努现在只存在于它们以前活动范围的20%从历史上看,尼努现象发生在温带和干旱地区,而亚拉拉人(小比尔比人、大白暨豚)只在沙质沙漠中发现。当欧洲人到来时,这两个物种都急剧减少。它们被狐狸和猫捕食,不得不与兔子竞争,并经历了文化火灾制度的变化
Yallara为中部沙漠的土著人民所熟知,但在20世纪60年代灭绝。由于其挖掘性质,尼努人作为“生态系统工程师”至关重要,如今尼努人仍生活在小规模、分散的种群中,主要分布在西澳大利亚州和北领地的中部沙漠
土著知识、比尔比仪式、故事和歌词仍然存在于全国各地,将遗址和人民联系在一起,即使在当地动物已经灭绝的地方也是如此
基因的重要性一个物种的遗传变异(跨基因组的变异)越多,它适应不断变化的世界的能力就越强。由于亚拉拉人的灭绝和尼努人的迅速减少,1979年建立了一个尼努人圈养繁殖计划。最初被安置在动物园里,1997年尼努人被放归岛屿和围栏保护区,以建立所谓的“集合种群”。为了确保它们的持久性,国家比尔比恢复团队试图在2016年至2021年间增加围栏保护区的数量。
使用我们的参考基因组和来自不同地点的363个尼努样本,我们能够确定每个地点的遗传多样性,以及这些地点之间的差异
我们使用这些基因数据来选择释放到保护区的个体。通过这种方法,我们产生了基因多样的后代,支持该物种的长期生存
我们可以从粪便中学到很多东西,尽管集合种群中大约有6000只尼努,但对野外的尼努知之甚少。几年来,Kiwirkurra社区土著游骑兵一直与西澳州保护、生物多样性和景点部合作利用我们的参考基因组并与我们的团队合作,部门科学家开发了一种新的粪便分析工具。利用他们的文化知识,土著游骑兵已经知道尼努住在哪里,吃什么,以及如何追踪他们
现在,通过收集它们的粪便,它们可以区分它们,并知道它们是什么性别,为游骑兵提供管理其尼努种群的信息
Kiwirkurra土著游骑兵Scott West指出:“将旧方法和新方法结合起来,有助于我们获得关于尼努以及如何照顾它们的良好信息。这就是双向科学。”
从2024年开始,在拯救比尔比基金和致命科学的支持下,我们正在与澳大利亚各地的土著社区合作,收集粪便,以便我们能够了解其范围内比尔的遗传多样性,并将其与集合种群进行比较
More information: Carolyn J. Hogg et al, Extant and extinct bilby genomes combined with Indigenous knowledge improve conservation of a unique Australian marsupial, Nature Ecology & Evolution (2024). DOI: 10.1038/s41559-024-02436-2Journal information: Nature Ecology & Evolution
Provided by The Conversation
2024-09-15
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